Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF3P18847 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF3P18847 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF3P18847 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF3P18847 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF3P18847 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF3P18847 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF3P18847 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF3P18847 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF3P18847 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF3P18847 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF3P18847 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF3P18847 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF3P18847 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF3P18847 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF3P18847 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF3P18847 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF3P18847 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATF3P18847 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATF3P18847 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF3P18847 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF3P18847 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF3P18847 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF3P18847 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF3P18847 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF3P18847 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF3P18847 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF3P18847 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF3P18847 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF3P18847 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF3P18847 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF3P18847 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF3P18847 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF3P18847 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF3P18847 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF3P18847 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms