Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB1P16220 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CREB1P16220 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms