Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD8BP10966 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms