Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR2F1P10589 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms