Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms