Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA5P08648 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA5P08648 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA5P08648 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA5P08648 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA5P08648 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA5P08648 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA5P08648 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA5P08648 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA5P08648 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA5P08648 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA5P08648 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA5P08648 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms