Protein–RNA interactions for Protein: O75365

PTP4A3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A3O75365 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTP4A3O75365 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTP4A3O75365 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTP4A3O75365 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTP4A3O75365 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTP4A3O75365 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTP4A3O75365 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTP4A3O75365 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTP4A3O75365 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTP4A3O75365 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTP4A3O75365 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTP4A3O75365 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTP4A3O75365 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTP4A3O75365 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTP4A3O75365 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTP4A3O75365 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTP4A3O75365 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTP4A3O75365 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTP4A3O75365 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTP4A3O75365 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTP4A3O75365 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms