Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms