Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPLO60437 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPLO60437 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPLO60437 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPLO60437 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPLO60437 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPLO60437 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPLO60437 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPLO60437 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPLO60437 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPLO60437 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPLO60437 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PPLO60437 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PPLO60437 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PPLO60437 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PPLO60437 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPLO60437 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPLO60437 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPLO60437 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPLO60437 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PPLO60437 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPLO60437 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPLO60437 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPLO60437 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPLO60437 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPLO60437 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PPLO60437 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PPLO60437 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPLO60437 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPLO60437 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPLO60437 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPLO60437 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPLO60437 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPLO60437 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPLO60437 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPLO60437 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPLO60437 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPLO60437 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPLO60437 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPLO60437 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPLO60437 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PPLO60437 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPLO60437 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPLO60437 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPLO60437 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPLO60437 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPLO60437 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPLO60437 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPLO60437 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPLO60437 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPLO60437 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPLO60437 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPLO60437 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPLO60437 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPLO60437 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPLO60437 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms