Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms