Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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