Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms