Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms