Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NDRG4Q9ULP0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms