Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms