Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms