Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SH3BP4Q9P0V3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SH3BP4Q9P0V3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SH3BP4Q9P0V3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SH3BP4Q9P0V3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SH3BP4Q9P0V3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SH3BP4Q9P0V3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SH3BP4Q9P0V3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SH3BP4Q9P0V3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SH3BP4Q9P0V3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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