Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms