Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms