Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms