Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB9BQ9NP90 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms