Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00597Q9H2U6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms