Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms