Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms