Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms