Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms