Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms