Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms