Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms