Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms