Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms