Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms