Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms