Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF13CQ96RJ3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms