Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms