Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFXN2Q96NB2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms