Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF354BQ96LW1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms