Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELP4Q96EB1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms