Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD2Q96BF3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms