Protein–RNA interactions for Protein: Q969D9

TSLP, Thymic stromal lymphopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSLPQ969D9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSLPQ969D9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSLPQ969D9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms