Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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RABGGTAQ92696 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
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RABGGTAQ92696 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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RABGGTAQ92696 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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RABGGTAQ92696 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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RABGGTAQ92696 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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RABGGTAQ92696 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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