Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3CQ92520 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3CQ92520 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3CQ92520 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3CQ92520 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3CQ92520 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3CQ92520 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3CQ92520 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3CQ92520 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3CQ92520 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3CQ92520 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3CQ92520 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3CQ92520 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3CQ92520 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms