Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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