Protein–RNA interactions for Protein: Q86U90

YRDC, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YRDCQ86U90 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
YRDCQ86U90 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
YRDCQ86U90 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
YRDCQ86U90 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
YRDCQ86U90 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
YRDCQ86U90 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
YRDCQ86U90 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
YRDCQ86U90 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
YRDCQ86U90 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
YRDCQ86U90 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
YRDCQ86U90 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YRDCQ86U90 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YRDCQ86U90 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms