Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms