Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms