Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms