Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms