Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
WSCD1Q658N2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms