Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FAM78BQ5VT40 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FAM78BQ5VT40 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FAM78BQ5VT40 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FAM78BQ5VT40 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FAM78BQ5VT40 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FAM78BQ5VT40 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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FAM78BQ5VT40 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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FAM78BQ5VT40 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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FAM78BQ5VT40 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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FAM78BQ5VT40 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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